Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Limd1Q9QXD8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limd1Q9QXD8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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