Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim44Q9QXA7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms