Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Homer2Q9QWW1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Homer2Q9QWW1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms