Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chaf1aQ9QWF0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chaf1aQ9QWF0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chaf1aQ9QWF0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms