Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rai2Q9QVY8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rai2Q9QVY8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rai2Q9QVY8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms