Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep6Q9JM62 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms