Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp1Q9JLK7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cabp1Q9JLK7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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