Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp2Q9JLK4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp2Q9JLK4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp2Q9JLK4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp2Q9JLK4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp2Q9JLK4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp2Q9JLK4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp2Q9JLK4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp2Q9JLK4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp2Q9JLK4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp2Q9JLK4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp2Q9JLK4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp2Q9JLK4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp2Q9JLK4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms