Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms