Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prg3Q9JL95 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms