Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gde1Q9JL56 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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