Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cnot9Q9JKY0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms