Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb3Q9JKS4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms