Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nova1Q9JKN6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nova1Q9JKN6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms