Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf3Q9JKL4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf3Q9JKL4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms