Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtrQ9JKK8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms