Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mrpl39Q9JKF7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 227.7 ms