Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scube2Q9JJS0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scube2Q9JJS0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scube2Q9JJS0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scube2Q9JJS0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scube2Q9JJS0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scube2Q9JJS0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scube2Q9JJS0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scube2Q9JJS0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scube2Q9JJS0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scube2Q9JJS0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scube2Q9JJS0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scube2Q9JJS0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scube2Q9JJS0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scube2Q9JJS0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Scube2Q9JJS0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scube2Q9JJS0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scube2Q9JJS0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Scube2Q9JJS0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scube2Q9JJS0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scube2Q9JJS0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scube2Q9JJS0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scube2Q9JJS0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scube2Q9JJS0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scube2Q9JJS0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scube2Q9JJS0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scube2Q9JJS0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scube2Q9JJS0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scube2Q9JJS0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms