Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ascl3Q9JJR7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ascl3Q9JJR7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ascl3Q9JJR7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms