Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN4

Oxct2a, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2aQ9JJN4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Oxct2aQ9JJN4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Oxct2aQ9JJN4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms