Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc86Q9JJ89 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc86Q9JJ89 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc86Q9JJ89 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms