Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnmb4Q9JIN6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnmb4Q9JIN6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms