Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gtf2ird1Q9JI57 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms