Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RabggtaQ9JHK4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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