Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET54

Palld, Palladin, mousemouse

Predictions only

Length 1,408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalldQ9ET54 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PalldQ9ET54 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PalldQ9ET54 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PalldQ9ET54 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PalldQ9ET54 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PalldQ9ET54 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PalldQ9ET54 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PalldQ9ET54 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PalldQ9ET54 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PalldQ9ET54 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PalldQ9ET54 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PalldQ9ET54 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PalldQ9ET54 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PalldQ9ET54 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PalldQ9ET54 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PalldQ9ET54 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PalldQ9ET54 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms