Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Brd4Q9ESU6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Brd4Q9ESU6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Brd4Q9ESU6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Brd4Q9ESU6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms