Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem27Q9ESG4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem27Q9ESG4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms