Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES70

Nek6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek6Q9ES70 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nek6Q9ES70 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek6Q9ES70 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms