Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3bQ9ES34 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms