Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clstn2Q9ER65 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Clstn2Q9ER65 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms