Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ndst3Q9EQH7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndst3Q9EQH7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms