Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU0

Upf1, Regulator of nonsense transcripts 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf1Q9EPU0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Upf1Q9EPU0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Upf1Q9EPU0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf1Q9EPU0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms