Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms