Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SyncQ9EPM5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SyncQ9EPM5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms