Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl4Q9DCU6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mrpl4Q9DCU6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms