Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnft1Q9DCN7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnft1Q9DCN7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms