Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt112Q9DCG9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt112Q9DCG9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt112Q9DCG9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt112Q9DCG9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt112Q9DCG9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt112Q9DCG9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt112Q9DCG9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt112Q9DCG9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt112Q9DCG9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt112Q9DCG9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt112Q9DCG9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt112Q9DCG9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt112Q9DCG9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt112Q9DCG9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt112Q9DCG9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt112Q9DCG9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt112Q9DCG9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trmt112Q9DCG9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms