Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pak1ip1Q9DCE5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms