Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syde1Q9DBZ9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms