Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc97Q9DBT3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc97Q9DBT3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms