Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ftsj3Q9DBE9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ftsj3Q9DBE9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms