Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Znf580Q9DB38 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf580Q9DB38 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf580Q9DB38 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf580Q9DB38 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf580Q9DB38 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf580Q9DB38 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf580Q9DB38 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf580Q9DB38 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf580Q9DB38 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf580Q9DB38 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf580Q9DB38 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf580Q9DB38 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf580Q9DB38 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf580Q9DB38 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Znf580Q9DB38 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf580Q9DB38 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf580Q9DB38 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Znf580Q9DB38 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Znf580Q9DB38 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Znf580Q9DB38 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Znf580Q9DB38 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Znf580Q9DB38 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Znf580Q9DB38 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf580Q9DB38 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znf580Q9DB38 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znf580Q9DB38 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znf580Q9DB38 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znf580Q9DB38 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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