Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD9

H2al1m, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1mQ9DAD9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1mQ9DAD9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1mQ9DAD9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1mQ9DAD9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1mQ9DAD9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1mQ9DAD9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1mQ9DAD9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1mQ9DAD9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1mQ9DAD9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1mQ9DAD9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms