Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmtm2bQ9DAC0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms