Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700018B08RikQ9DA83 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700018B08RikQ9DA83 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms