Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem239Q9DA47 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem239Q9DA47 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms