Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sgf29Q9DA08 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sgf29Q9DA08 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms