Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnot8Q9D8X5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms