Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms