Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan17Q9D7W4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan17Q9D7W4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms